宝可梦自身会因为各种原因导致进化，借由个体突破某种枷锁，产生进化之光，然后沐浴进化之光，进化到更高一阶的种族。宝可梦进化之后，属于另外一个种族，自身的种族值会发生改变，向着更加强大的方向进化，但个体值以及努力值等不发生变化，特性一般而言不会改变，但有个别宝可梦进化之后特性会发生改变。

特性改变的原因一种是因为更高一阶的种族特性不包含原本特性，所以导致改变，一种是因为其他外在原因发生改变。

特性并非都是对宝可梦有正面效果的，某些特性会对宝可梦造成负面效果，还有一些则是在正面效果的基础上附带负面效果。

宝可梦的进化目前一直是研究对象，这种奇异的生物进化方式似乎和人类有某种联系。

现在已知的进化方式共有以下几种：

一阶段进化：幼体的宝可梦经过时间积累，能量达到一定数额，就可以自然进化，这类进化没有枷锁束缚，是幼体进化到成长体的正常经历，但有例外的幼体宝可梦，需要借助其他方式进化。

二阶段进化：由成长体的宝可梦进化到完全体的宝可梦，会产生大幅度的提升，这个进化需要大量的能量作为支撑，还需要自身达到某些要求，野生宝可梦一般都会停留在成长体。这个进化过程产生的进化之光据说对其他宝可梦也有意想不到的好处。

例如从小火龙→火恐龙→喷火龙，幼生体是小火龙，一阶段进化之后就是火恐龙，然后二阶段进化之后就是喷火龙。目前研究人员认为小火龙并不是喷火龙的幼生体，虽然小火龙是从蛋内孵化出来的，但所具备的能量标准对比其他幼生体过于超出，因此提出了幼生体进化这一假设，认为还有更加低阶段的宝可梦存在，目前无法验证。

超级进化：又称ge进化以及百万进化，出现于卡洛斯地区的新进化方式。超级进化更像是状态类的进化，属于暂时性进化，在对战中借由训练家和宝可梦之间利用超级石以及进化钥石共鸣，从来使完全体的宝可梦再一次进化。这类进化会给宝可梦带来巨幅的种族提升，同时特性和属性都会可能发生改变。超级进化需要宝可梦和训练师之间的牵绊很深才能达到。超级进化结束后，有些宝可梦会因此受到伤害，例如赫拉托克斯会因此全身疼痛。值得一提的是，超级进化所需要的进化钥石共有两种，因此，一些宝可梦会拥有两种超级进化的形态。

牵绊变身：这是属于某些宝可梦的特性，被认定是进化中的一环。这类进化借由宝可梦的特性【牵绊变身】进行进化，需要和训练师之间有着非常深厚的牵绊才能做到。进化后会改变自身的技能释放形态，某些技能也会超出常规状态。属于暂时性状态类进化，主要是对技能方面的增益。