另一位著名的反清复明活动家是平一统，他在江南一带秘密收集反清复明分子，在张名振北伐后，他积极为发动起义做准备，但是最终失败。平一统、贺王盛、睦本等人最后均被捕，涉案的人数颇多，多数人被清廷下令残酷杀害。

大西军二号领人物李定国试图开辟广东通道以取得同郑成功的联系，而大西军的领袖孙可望也试图通过长江沿线打通与郑氏集团会师的通道，实现两大反清集团的联合作战。张名振所收到的蜡书，正是孙可望希望与郑成功、张名振的海军会师长江的计划。

张名振在得悉大西军的计划后，没有迟疑，便于1654年初，率战船数百艘第二次入长江，过京口，掠仪真，一路逆流而上，直抵瓜州。正月十三日，舰队在金山登陆，缴清军大炮十尊。南明海军在长江横冲直撞，清军根本没法在水面与之抗衡。

张名振躇踌满志，与诚意伯刘孔昭携五百人登山访寺，寺庙里的和尚乘机持薄募化，张名振大笑道：“大兵到此，秋毫不扰，尚募化乎？”下令助米盐各十担。

次日，张名振身着纱帽青袍角带，向东南方向遥祭明孝陵，并赋诗一首：

十年横海一孤臣，佳气钟山望里真。

鹑首义旗方出楚，燕去羽檄已通闽。

王师枹鼓心肝噎，父老壶浆涕泪亲。南望孝陵兵缟素，看会大纛祃龙津。

诗的前言是\"予以接济秦藩，师泊金山，遥拜孝陵有感”，后记是：“甲午年孟春月，定西侯张名振同诚意伯题”。

由于没有接到上游孙可望发兵的消息，两天后，张名振在夺取清军所抛弃的辎重后，率舰队东下。

在张名振率部二入长江之际，郑成功增派援军到平洋沙。郑成功的部将、戎政司马陈六斌、都督程应璠率军会同驻留此地的平原将军姚志倬等部，一起进攻清军的崇明岛基地，企图乘清军在平洋沙战役受重创之后，一鼓作气拿下崇明，但是这次作战并没有取得预期的效果，反而被清军击退，非常可惜的是，姚志倬也在这次进攻中战死。崇明之战失利，再度暴露出郑军在攻城上的弱势，但在海洋上，郑军海军仍然是无敌的，陈六斌、程应璠率海军攻击吴淞，掠夺敌船二百艘。张名振的舰队东下之后，游弋于长江一线，并在三月在扬州府治下的吕四场登陆，击败了守备的清军，缴获大河营守备印。四月，张名振的海军又杀回镇江、仪真，但是仍然没有孙可望大西军的出动的消息，由于军饷困难，张名振向这一带的盐商索派军饷，遭到拒绝后，张名振大怒，指挥战船袭击盐船，焚毁盐船六百艘，这使得清廷\"折耗课赋商本数十万”，之后又撤退到长江口。

五月，张名振率军进逼吴淞关，击毙清军四百余人，夺取各种船只三百七十艘，牢牢地控制东南的制海权。他意犹未足，派出六十只沙船，北上山东的登州、莱州一带的海域，一直到高丽然后才安全返航。

张名振两次欲接济孙可望的东下军队，均以失望而告终。孙可望之所以没有成行的原因，在于大西军的内部分裂开始加剧，他与李定国已经决裂，与永历帝也是貌合神离，与大西军的第三号人物刘文秀也有裂痕，种种原因，导致了他设想的与张名振实现长江会师的计划没能实现。

虽然张名振的海军进出长江如入无人之境，但是粮饷上的不足一直成为其舰队的心腹之患，他南下浙江温州买米七船，以解粮食馈乏的燃眉之急。而后，张名振又一次返回厦门岛，向郑成功提出请求，补充兵力、武器、粮饷等，郑成功答应派遣忠靖伯陈辉率海陆军一万五千人，战船百艘北上支援。于是张名振再次出发北上，这位海上英雄往返奔波于厦门岛与长江之间，其不畏艰辛之精神令人钦佩。

九月，张名振师抵上海县城，上海震动。十二月，张名振海军再一次溯长江而上，在朱家咀劫持并焚毁江西的粮船，深入到南京郊外的燕子矶，不仅南京震动，东南半壁亦为之震动。不过张名振的海军虽然在江面上称雄，在陆地上却难以有效攻破坚固的城池。

1653年、1654年初与年底的三次入长江之役，在军事上取得了一些战果，破坏了敌占区的经济，对清军的水上力量也进行沉重打击，巩固了南明海军的水上优势，但相比之下，政治意义更加重大，这几次规模不大的北伐，给江南沦陷区的人民予坚持抗清的希望，激励更多的志士仁人为复业事业而奔走，同时也证明了郑成功与满清政府的所谓谈判，不过只是一种权宜之下的策略。也正是因为看到郑成功这种坚持抗清的信念，大西军的李定国才会再度约请郑成功联合作战，会师广东。

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